33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4746 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  45.87 
 
 
273 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  47.69 
 
 
273 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  42.45 
 
 
283 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  49.65 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  46.98 
 
 
217 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  43.41 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  37.02 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  37.9 
 
 
212 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  46.54 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  37.22 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  46.98 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0158  hypothetical protein  48.18 
 
 
165 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.904262  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  48.39 
 
 
275 aa  127  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  43.94 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  36.82 
 
 
264 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  47.66 
 
 
259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  38.2 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  33.82 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  34.11 
 
 
302 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  38.75 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  41.53 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  36.44 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  29.19 
 
 
560 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  32.48 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0740  hypothetical protein  29.01 
 
 
291 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  34.48 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  24.86 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  23.62 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5870  hypothetical protein  27.52 
 
 
267 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.192295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>