32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6159 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  60.38 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  48.84 
 
 
302 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  48.52 
 
 
275 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  50.24 
 
 
259 aa  175  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  36.41 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  34.88 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  44.52 
 
 
221 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  44.37 
 
 
215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  42.77 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  34.62 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  43.1 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  49.19 
 
 
217 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  47.54 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  45.21 
 
 
197 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  43.24 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  40.52 
 
 
316 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  36.08 
 
 
226 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  37.42 
 
 
236 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0158  hypothetical protein  36.62 
 
 
165 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.904262  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  32.88 
 
 
211 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  41.38 
 
 
224 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  40.14 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  35.92 
 
 
211 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  35 
 
 
205 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  29.75 
 
 
189 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  30.71 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  30.08 
 
 
204 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  32.11 
 
 
560 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  31.5 
 
 
202 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5870  hypothetical protein  26.13 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.192295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>