33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0292 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  50.97 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  35.71 
 
 
235 aa  89.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  32.06 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  26.97 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  36.15 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  29.73 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  36.84 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  30.36 
 
 
316 aa  64.7  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  36.3 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  31.5 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  33.06 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  30.91 
 
 
273 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  31.18 
 
 
273 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1408  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  26.9 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  36.44 
 
 
221 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  31.75 
 
 
264 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0158  hypothetical protein  30.83 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.904262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  29.91 
 
 
560 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  27.83 
 
 
289 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  33.86 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  29.67 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  27.21 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  27.87 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  25.4 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0740  hypothetical protein  27.56 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  31.2 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  29.51 
 
 
302 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  32.22 
 
 
224 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>