30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4036 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  554  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  91.58 
 
 
273 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  50 
 
 
221 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  43.78 
 
 
236 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  39.44 
 
 
219 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  45.27 
 
 
217 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  50.36 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  35.81 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  45 
 
 
302 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  44.6 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  41.33 
 
 
212 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  43.46 
 
 
197 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  48.28 
 
 
231 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  37.89 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0158  hypothetical protein  46.88 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.904262  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  40.21 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  40.21 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  41.54 
 
 
211 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  38.51 
 
 
208 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  34.41 
 
 
211 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  38.31 
 
 
233 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  35.64 
 
 
316 aa  99  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  36.36 
 
 
236 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  41.67 
 
 
224 aa  95.5  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  32.28 
 
 
560 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  32.46 
 
 
235 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  26.32 
 
 
189 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  27.88 
 
 
205 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>