22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5870 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5870  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.192295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0740  hypothetical protein  70.15 
 
 		 291 aa  332  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1408  hypothetical protein  29.79 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  28 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  25.66 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  26.46 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  25.11 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  28.45 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  31.33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  29.02 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  26.13 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  42.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  26.49 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  29.38 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  23.86 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  28.3 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  27.52 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  35.37 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  29.19 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  24.06 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  29.46 
 
 		 224 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>