87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29600  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  100 
 
 		 82 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.67 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  53.62 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  53.97 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  56.34 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  52.24 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  49.25 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  56.25 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50.75 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  50 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50.82 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.76 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  50.82 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  49.32 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  42.25 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.97 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  57.97 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.06 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.48 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  41.27 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  53.52 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.94 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1265  ATP synthase F0, C subunit  54.84 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1800  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.217172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  38.03 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  44.07 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  47.46 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 		 122 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.85 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  45.76 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  35.48 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  39.39 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21450  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  51.43 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  41.79 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  42.37 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  42.37 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  44.9 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.29 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  41.07 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  36.07 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  42.37 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  41.07 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  39.58 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 		 75 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12100  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  50 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  38.24 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  39.68 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  36.07 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  35.59 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  44.9 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3712  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.07 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  42.22 
 
 		 70 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>