193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25970  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  296  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5533  thioesterase superfamily protein  55.73 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  59.5 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  61.95 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2042  thioesterase superfamily protein  57.38 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  58.62 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  59.17 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3007  hypothetical protein  52.54 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5678  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  56.41 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3038  thioesterase superfamily protein  54.24 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000070991  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2853  thioesterase superfamily protein  54.92 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000521019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1970  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  53.85 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  58.26 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11110  hypothetical protein  49.25 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2062  hypothetical protein  51.28 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00354205  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1508  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1801  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3256  hypothetical protein  49.17 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3054  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1225  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.541644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  41.73 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  41.6 
 
 		 195 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  49.17 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  45.54 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  44.17 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  46.03 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  43.97 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  43.97 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  43.97 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  43.97 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  40.32 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  45.37 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  43.12 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  43.31 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  39.52 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  39.52 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  40.77 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  41.23 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  39.52 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  40.5 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  39.52 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  39.52 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  39.52 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  37.98 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  39.52 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0199  phenylacetic acid degradation-related protein  42.97 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  42.48 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  39.52 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  40.15 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  42.52 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  41.98 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  40.16 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  40.31 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  40.31 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  42.2 
 
 		 140 aa  84.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  42.2 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  44.25 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 		 134 aa  83.6  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  41.8 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  41.07 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  41.59 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  40.98 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  40.98 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  41.96 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  41.07 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  39.17 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  41.07 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>