49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  100 
 
 		 164 aa  336  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  41.22 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  40.54 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  38.51 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  38.51 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  38.93 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  41.06 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  41.22 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  40.13 
 
 		 328 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  37.16 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  37.84 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  36.49 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  37.84 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  38.06 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  35.81 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  35.57 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  34.78 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  34.23 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  36.91 
 
 		 300 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  34.55 
 
 		 212 aa  97.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  35.81 
 
 		 210 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 272 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  34.9 
 
 		 337 aa  90.5  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  34.46 
 
 		 217 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  34.75 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  33.78 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  32.35 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 		 330 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  38.83 
 
 		 418 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  33.66 
 
 		 416 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  32.35 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  32.35 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  32.35 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  30 
 
 		 394 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 303 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  28.67 
 
 		 231 aa  47.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  26.85 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  26.67 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  26.88 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  20.66 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  29.09 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  23.14 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  23.26 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>