52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  100 
 
 
375 aa  741    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  48.65 
 
 
351 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  39.62 
 
 
367 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  30.87 
 
 
426 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  30.87 
 
 
426 aa  176  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  39.57 
 
 
366 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  29.28 
 
 
413 aa  165  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  30.68 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  31.75 
 
 
434 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  30.35 
 
 
431 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  30.93 
 
 
426 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  31.2 
 
 
448 aa  149  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  29.66 
 
 
424 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  25.88 
 
 
427 aa  145  9e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  36.34 
 
 
430 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  29.36 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  31.72 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
400 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  28.3 
 
 
401 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  24.42 
 
 
422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  24.08 
 
 
420 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  27.53 
 
 
442 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  25 
 
 
450 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  26.26 
 
 
423 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  31.41 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  26.56 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  27.81 
 
 
344 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  24.58 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  30.55 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  26.3 
 
 
393 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  28.72 
 
 
431 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  28.64 
 
 
418 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  26.33 
 
 
413 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  25.54 
 
 
420 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  25.43 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  24.01 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  24.53 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  26.8 
 
 
445 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  22.6 
 
 
600 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  24.46 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  23.33 
 
 
599 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  29.17 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  28.22 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  23.58 
 
 
429 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  27.84 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  26.59 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  32.76 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  29.77 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  29.21 
 
 
88 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  26.01 
 
 
560 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  23.79 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  28.99 
 
 
394 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>