35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  100 
 
 		 330 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.2 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  35.28 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  31 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.32 
 
 		 391 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.99 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.02 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  31.91 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  30.21 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  31.12 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  45.39 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  35.91 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.88 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  29.97 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  42.36 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.66 
 
 		 392 aa  99.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  42.36 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  42.36 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.52 
 
 		 497 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.88 
 
 		 350 aa  89  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  31.23 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  36.73 
 
 		 419 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  32.52 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  31.37 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  35.95 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  22.76 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  33.06 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.75 
 
 		 364 aa  45.8  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.92 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 		 706 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00326971  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  28.69 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.39 
 
 		 604 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.3 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.77 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.64 
 
 		 604 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>