More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0761 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
225 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.307921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0490  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  68.64 
 
 
220 aa  320  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.23 
 
 
243 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.8 
 
 
407 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.85 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  32.67 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.05 
 
 
256 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.03 
 
 
386 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.29 
 
 
236 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  33.01 
 
 
247 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.85 
 
 
237 aa  105  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
347 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.12 
 
 
393 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.8 
 
 
216 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.38 
 
 
259 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  29.63 
 
 
249 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 
390 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.66 
 
 
355 aa  98.2  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.1 
 
 
393 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  31.43 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1283  thiamine biosynthesis protein ThiF family protein  32.76 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.67 
 
 
266 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.59 
 
 
387 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.61 
 
 
254 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1261  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.05 
 
 
246 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.1 
 
 
266 aa  95.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  29.56 
 
 
393 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  33.12 
 
 
345 aa  95.1  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.93 
 
 
398 aa  94.7  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  31.68 
 
 
340 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.1 
 
 
386 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1418  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  36.02 
 
 
341 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.39 
 
 
393 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  36.36 
 
 
368 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1233  molybdopterin biosynthesis protein  30.51 
 
 
269 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 
368 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.27 
 
 
390 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.61 
 
 
252 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.1 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.44 
 
 
259 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  29.19 
 
 
282 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.08 
 
 
393 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.59 
 
 
392 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.87 
 
 
397 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.41 
 
 
356 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.43 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.99 
 
 
395 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0012  hypothetical protein  31.19 
 
 
340 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.650059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
396 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.62 
 
 
396 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.67 
 
 
403 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.19 
 
 
400 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.19 
 
 
400 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.35 
 
 
390 aa  92  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.11 
 
 
386 aa  92  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1158  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.08 
 
 
264 aa  92  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0720716  normal  0.0953853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.94 
 
 
364 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.27 
 
 
367 aa  92  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.65 
 
 
392 aa  92  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  31.79 
 
 
388 aa  91.7  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.26 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.73 
 
 
282 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.1 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38 
 
 
380 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.46 
 
 
392 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.45 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.11 
 
 
400 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.97 
 
 
390 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.77 
 
 
383 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  29.06 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.64 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  30.2 
 
 
258 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08540  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  29.52 
 
 
403 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.151924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  29.21 
 
 
389 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  34.97 
 
 
390 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1246  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.26 
 
 
371 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000103579  normal  0.557515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.64 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.69 
 
 
387 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.82 
 
 
348 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.61 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  32.98 
 
 
409 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.05 
 
 
392 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.75 
 
 
303 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.39 
 
 
258 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.49 
 
 
266 aa  88.6  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
361 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  29.11 
 
 
252 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.67 
 
 
443 aa  88.2  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.29 
 
 
244 aa  88.2  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4877  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.52 
 
 
343 aa  88.2  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  28.7 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  27.62 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.57 
 
 
390 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.78 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.32 
 
 
275 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  29.63 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.79 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  31.14 
 
 
390 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  29.17 
 
 
269 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.95 
 
 
249 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>