15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4411 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4411  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4886  hypothetical protein  67.88 
 
 		 250 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4121  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 424 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  39 
 
 		 444 aa  54.7  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  36.84 
 
 		 274 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 431 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 117 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0080  hypothetical protein  65.38 
 
 		 116 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 461 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 270 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>