More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4344 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4344  protein kinase  100 
 
 
504 aa  1001    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927166  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4785  serine/threonine protein kinase  83.25 
 
 
395 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3960  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.59 
 
 
550 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1065  serine/threonine protein kinase  47.33 
 
 
577 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  46.38 
 
 
591 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6706  serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 
664 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0848687  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
1009 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  37.55 
 
 
1009 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  37.55 
 
 
1017 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  35.31 
 
 
1110 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 
519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  36.51 
 
 
993 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
605 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1294  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 
581 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.65 
 
 
678 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1338  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 
602 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000158737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0956  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
473 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07550  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
568 aa  136  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0745777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1757  serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21540  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2211  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529503  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  37.18 
 
 
1018 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
558 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  37.69 
 
 
1032 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  39.7 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  37.35 
 
 
1032 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
464 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 
522 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3381  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
289 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
460 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
468 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05610  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
693 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.850356  normal  0.365615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 
502 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3125  protein kinase  34.9 
 
 
466 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1152  serine/threonine protein kinase  38.92 
 
 
590 aa  123  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.351224  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0943  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.46 
 
 
489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal  0.789062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
646 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.97 
 
 
642 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
419 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
776 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 
562 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 
612 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
985 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0491  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0764361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 
754 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
982 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.01 
 
 
696 aa  117  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  28.01 
 
 
641 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.41 
 
 
1856 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
776 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.93 
 
 
620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 
705 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 
498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.93 
 
 
621 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  35.81 
 
 
1100 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
982 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 
611 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
581 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 
612 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.87 
 
 
551 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 
445 aa  113  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2229  protein kinase  36.82 
 
 
500 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681599  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
631 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.61 
 
 
587 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  34.47 
 
 
675 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
990 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.87 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3456  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.61 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00571523  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.21 
 
 
1044 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.11 
 
 
647 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 
659 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.59 
 
 
584 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  34.26 
 
 
626 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
989 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
642 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.13 
 
 
668 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  36.15 
 
 
654 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  31.65 
 
 
575 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
557 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
554 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  32.39 
 
 
593 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  34.74 
 
 
963 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
444 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
575 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
824 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.32 
 
 
531 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
695 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
605 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.14 
 
 
662 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.27 
 
 
596 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>