42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2489 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 309 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  89 
 
 		 309 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  69.73 
 
 		 305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.67 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.89 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.8 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.65 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.51 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.77 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  22.61 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  24.19 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.72 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.4 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.49 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.18 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.18 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.39 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  24.79 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  24.6 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.5 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.4 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.67 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.12 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.22 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.32 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  23.2 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.43 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.9 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.26 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.85 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  24.58 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>