More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2397 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
494 aa  994    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  63.9 
 
 
500 aa  634    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  87.25 
 
 
494 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  61.44 
 
 
489 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  57.68 
 
 
510 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  61.25 
 
 
479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  55.44 
 
 
493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  54.12 
 
 
491 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  55.71 
 
 
500 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  53.01 
 
 
527 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  55.31 
 
 
532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  55.31 
 
 
532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  56.88 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  55.31 
 
 
532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  55.31 
 
 
532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  55.31 
 
 
532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  55.11 
 
 
532 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  55.11 
 
 
532 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  54.51 
 
 
532 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  56.88 
 
 
505 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  55.46 
 
 
516 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  53.09 
 
 
489 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  53.64 
 
 
499 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  55.99 
 
 
520 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  58.45 
 
 
522 aa  548  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  52.88 
 
 
489 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  52.88 
 
 
489 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 
520 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  53.78 
 
 
499 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  55.37 
 
 
530 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  54.64 
 
 
516 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  55.3 
 
 
530 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  52.78 
 
 
497 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  55.72 
 
 
520 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  55.3 
 
 
530 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  54.68 
 
 
524 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  56.52 
 
 
503 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  54.36 
 
 
495 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  54.04 
 
 
508 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  56.93 
 
 
509 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  53.4 
 
 
508 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  55.7 
 
 
498 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  51.45 
 
 
491 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  53.8 
 
 
505 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  54 
 
 
500 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  52.05 
 
 
508 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  54 
 
 
506 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  56.04 
 
 
477 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  54.04 
 
 
509 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  53.53 
 
 
485 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  56.04 
 
 
504 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  53.46 
 
 
510 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  50.31 
 
 
508 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  53.94 
 
 
495 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  49.08 
 
 
493 aa  491  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  49.38 
 
 
491 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  53.42 
 
 
498 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  51.17 
 
 
494 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  46.71 
 
 
507 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  47.49 
 
 
503 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  50.31 
 
 
494 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  50.31 
 
 
494 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  48.02 
 
 
486 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  50.1 
 
 
494 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  50.11 
 
 
513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  48.44 
 
 
509 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  48.19 
 
 
496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  47.2 
 
 
499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  48.4 
 
 
514 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  47.28 
 
 
484 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  47.33 
 
 
500 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  46.09 
 
 
502 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  45.76 
 
 
544 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  49.89 
 
 
508 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  46.76 
 
 
509 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  42.02 
 
 
540 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.229134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  45.45 
 
 
503 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 
510 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  44.1 
 
 
486 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  43.2 
 
 
505 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 
514 aa  362  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13773  oxidoreductase  54.17 
 
 
224 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  29.08 
 
 
650 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  29.95 
 
 
508 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  28.28 
 
 
505 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  27.17 
 
 
526 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  28.1 
 
 
540 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  27.17 
 
 
526 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  27.57 
 
 
529 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  27.17 
 
 
526 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  27.7 
 
 
548 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  27.8 
 
 
526 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  25.66 
 
 
570 aa  149  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  28.54 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  29.79 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  27.67 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  28.43 
 
 
524 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>