More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2346 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  100 
 
 		 316 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  89 
 
 		 310 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.13 
 
 		 311 aa  354  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  55.91 
 
 		 311 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  57.51 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  56.13 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  55.02 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  55.02 
 
 		 309 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  55.02 
 
 		 312 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  54.98 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.63 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  54.4 
 
 		 319 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  54.69 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  54.09 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  55.16 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  54.34 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  54.78 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  54.14 
 
 		 316 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  54.05 
 
 		 307 aa  322  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  52.44 
 
 		 306 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  51.45 
 
 		 308 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  54.48 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  54.84 
 
 		 310 aa  311  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  52.68 
 
 		 321 aa  310  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  53.55 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  52.56 
 
 		 311 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  49.19 
 
 		 308 aa  302  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  51.27 
 
 		 317 aa  292  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  39.06 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  37.38 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  36.22 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  38.82 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  33.55 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  37.5 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  37.5 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  37.1 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  34.94 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  34.85 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  38.31 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  31.6 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  32.58 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  35.48 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  31.94 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  31.94 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  40.19 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  39.72 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  39.72 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  31.92 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  30.79 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  32.67 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  32.33 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  38.57 
 
 		 287 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  32.33 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  33.45 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  31.87 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  30.7 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  36.8 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  31.62 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  31.62 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  31.62 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  32 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.93 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.46 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  31.92 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  33.33 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.45 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  30.45 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.62 
 
 		 265 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  36.09 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  36.19 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  33.7 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  37.02 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  31.95 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  27.8 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  40.91 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  29.33 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  31.77 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.23 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  34.69 
 
 		 353 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  31.62 
 
 		 258 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  35.85 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  34.05 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  24.84 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  29.78 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  31.88 
 
 		 264 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  31.88 
 
 		 264 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>