295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2269 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  87.85 
 
 		 543 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 559 aa  1068    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3946  apolipoprotein N-acyltransferase  48.72 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  51.08 
 
 		 536 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  50.81 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  49.9 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  47.6 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  46.84 
 
 		 540 aa  362  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  46.95 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  46.91 
 
 		 883 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2933  apolipoprotein N-acyltransferase  46.53 
 
 		 583 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000865373  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3419  apolipoprotein N-acyltransferase  43.5 
 
 		 551 aa  327  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3117  apolipoprotein N-acyltransferase  42.28 
 
 		 560 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0355571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  43.58 
 
 		 566 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  44.12 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  44.12 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  45.24 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2539  apolipoprotein N-acyltransferase  44.12 
 
 		 573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524723  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  43.85 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18480  apolipoprotein N-acyltransferase  44.12 
 
 		 524 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  42.42 
 
 		 527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  42.08 
 
 		 551 aa  312  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2863  apolipoprotein N-acyltransferase  41.67 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1533  apolipoprotein N-acyltransferase  41.52 
 
 		 581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2629  apolipoprotein N-acyltransferase  44.56 
 
 		 515 aa  299  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  41.73 
 
 		 518 aa  290  7e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  42.45 
 
 		 508 aa  290  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14080  apolipoprotein N-acyltransferase  39.81 
 
 		 533 aa  286  5e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225972  normal  0.302193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4508  apolipoprotein N-acyltransferase  41.61 
 
 		 568 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  39.6 
 
 		 551 aa  279  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2199  apolipoprotein N-acyltransferase  41.58 
 
 		 522 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4185  apolipoprotein N-acyltransferase  42.92 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5817  Apolipoprotein N-acyltransferase-like protein  40.04 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272998  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  40.96 
 
 		 874 aa  273  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2204  apolipoprotein N-acyltransferase  41.77 
 
 		 552 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  36.63 
 
 		 546 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2272  apolipoprotein N-acyltransferase  46.13 
 
 		 547 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000100111  hitchhiker  0.0030022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25890  apolipoprotein N-acyltransferase  41.57 
 
 		 528 aa  230  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1775  apolipoprotein N-acyltransferase  43.62 
 
 		 606 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.629044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 		 521 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  31.53 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.17 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.22 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.42 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 		 509 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  26.84 
 
 		 506 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  27.29 
 
 		 525 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  26.63 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  27.48 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  27.01 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  26.2 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  27.84 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 529 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 529 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 529 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 529 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  23.09 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  26.4 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  28.03 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  25.89 
 
 		 511 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  28.94 
 
 		 507 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  26.96 
 
 		 528 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  27.74 
 
 		 505 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  27.54 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  27.79 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  27.34 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  28.78 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  26.3 
 
 		 526 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  26.1 
 
 		 501 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  26.38 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  28.35 
 
 		 542 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  26.46 
 
 		 516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  25.37 
 
 		 518 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  26.18 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  24.76 
 
 		 521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  28.94 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  27.27 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  27.77 
 
 		 505 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  25.7 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  25.83 
 
 		 515 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  25.83 
 
 		 515 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  25.83 
 
 		 515 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 		 511 aa  110  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  24.47 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  24.84 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.11 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>