More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0848 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11871  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
478 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146983  normal  0.269192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2440  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  75.37 
 
 
498 aa  731    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0780  IMP dehydrogenase family protein  71.82 
 
 
478 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0273  IMP dehydrogenase family protein  70.35 
 
 
477 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0848  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  946    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.415468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0791  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  95.41 
 
 
479 aa  912    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.151269  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1718  IMP dehydrogenase family protein  69.75 
 
 
484 aa  639    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0285  IMP dehydrogenase family protein  75.57 
 
 
479 aa  735    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7161  IMP dehydrogenase  74.11 
 
 
479 aa  715    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  0.0266118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2437  IMP dehydrogenase family protein  74.53 
 
 
479 aa  726    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.692486  normal  0.0531703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  75.78 
 
 
479 aa  717    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16310  IMP dehydrogenase family protein  70.16 
 
 
484 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0718  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.89 
 
 
477 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1231  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.37 
 
 
485 aa  686    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.861851  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2202  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.98 
 
 
487 aa  693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2608  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.44 
 
 
478 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0642643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31560  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.1 
 
 
479 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1899  IMP dehydrogenase family protein  68.87 
 
 
482 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2316  IMP dehydrogenase family protein  68.48 
 
 
479 aa  628  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3090  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
478 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2763  IMP dehydrogenase family protein  64.93 
 
 
478 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1951  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
485 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2840  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.81 
 
 
478 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2813  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.81 
 
 
478 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3360  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.22 
 
 
478 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.731194  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2644  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.64 
 
 
492 aa  608  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2857  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.81 
 
 
478 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.85 
 
 
493 aa  585  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09190  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 
486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3133  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.7 
 
 
478 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3135  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.44 
 
 
478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0649238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3329  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.24 
 
 
478 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3243  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.24 
 
 
478 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37 
 
 
508 aa  282  8.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.51 
 
 
504 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37 
 
 
488 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.74 
 
 
488 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.42 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.65 
 
 
493 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.05 
 
 
482 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.05 
 
 
482 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.92 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.92 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.28 
 
 
485 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.85 
 
 
489 aa  270  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.14 
 
 
476 aa  268  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.65 
 
 
493 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
487 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.16 
 
 
483 aa  263  6e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.58 
 
 
486 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
485 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
484 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.46 
 
 
486 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.1 
 
 
491 aa  261  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.94 
 
 
487 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.86 
 
 
493 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
487 aa  259  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
487 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
487 aa  259  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
487 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
483 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.31 
 
 
488 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.56 
 
 
493 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.03 
 
 
485 aa  259  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
487 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.26 
 
 
490 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
487 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
487 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
487 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.32 
 
 
497 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.39 
 
 
485 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
484 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.08 
 
 
494 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.06 
 
 
488 aa  257  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.8 
 
 
504 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
487 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.75 
 
 
490 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
485 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.76 
 
 
503 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.31 
 
 
485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.32 
 
 
483 aa  253  6e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
496 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.57 
 
 
486 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  35.11 
 
 
484 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.66 
 
 
490 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.37 
 
 
494 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.6 
 
 
507 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.74 
 
 
498 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.71 
 
 
484 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.68 
 
 
491 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.71 
 
 
496 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.44 
 
 
498 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.67 
 
 
493 aa  248  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
489 aa  248  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.95 
 
 
496 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.92 
 
 
495 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.2 
 
 
483 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
482 aa  247  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.17 
 
 
482 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>