242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0770 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 
366 aa  740    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  67.12 
 
 
370 aa  479  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  59.35 
 
 
366 aa  435  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  57.07 
 
 
365 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  56.64 
 
 
365 aa  376  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  57.58 
 
 
351 aa  375  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  45.09 
 
 
345 aa  299  5e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.13 
 
 
357 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  49.85 
 
 
342 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  46.2 
 
 
350 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  45.4 
 
 
346 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  45.2 
 
 
346 aa  289  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  47.25 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  44.86 
 
 
346 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  47.09 
 
 
349 aa  285  9e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  45.72 
 
 
321 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  43.23 
 
 
346 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  44.44 
 
 
358 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  45.72 
 
 
321 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  45.43 
 
 
323 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.98 
 
 
349 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.17 
 
 
348 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.07 
 
 
348 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  44.22 
 
 
346 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.45 
 
 
348 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  45.13 
 
 
321 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.87 
 
 
342 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.45 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.89 
 
 
348 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.75 
 
 
348 aa  272  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.89 
 
 
348 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.89 
 
 
347 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  45.58 
 
 
348 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.89 
 
 
348 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  46.33 
 
 
343 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  46.33 
 
 
343 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.13 
 
 
346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.65 
 
 
356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  43.93 
 
 
354 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  45.56 
 
 
354 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  47.16 
 
 
346 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.05 
 
 
355 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  43.93 
 
 
349 aa  263  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.97 
 
 
332 aa  262  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.84 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  45.97 
 
 
334 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.82 
 
 
369 aa  262  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  46.91 
 
 
351 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.94 
 
 
329 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  45 
 
 
355 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  43.9 
 
 
327 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.48 
 
 
350 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  45.37 
 
 
332 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.81 
 
 
378 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  45.38 
 
 
353 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  42.03 
 
 
354 aa  255  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.48 
 
 
350 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  43.48 
 
 
350 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.96 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.77 
 
 
353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.43 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.67 
 
 
346 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  44.71 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  44.41 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.15 
 
 
354 aa  252  6e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  44.21 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  41.89 
 
 
338 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  42 
 
 
350 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  43.11 
 
 
345 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  40.82 
 
 
353 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 
354 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  42.74 
 
 
372 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.82 
 
 
348 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.51 
 
 
351 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.67 
 
 
362 aa  247  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 
354 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.76 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.12 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.74 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  43.36 
 
 
346 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  44.21 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  41.12 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  42.61 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.24 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.12 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.16 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.21 
 
 
353 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.55 
 
 
351 aa  242  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.11 
 
 
354 aa  242  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.67 
 
 
353 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.26 
 
 
351 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.46 
 
 
353 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.44 
 
 
358 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  40.12 
 
 
347 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.35 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.26 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.26 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  40.51 
 
 
349 aa  238  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  41.16 
 
 
344 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.88 
 
 
358 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>