26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0102 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  100 
 
 
609 aa  1232    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  55.39 
 
 
600 aa  720    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.901274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  26.25 
 
 
521 aa  157  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1296  AAA ATPase  26.3 
 
 
537 aa  143  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0819436 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  29.01 
 
 
595 aa  143  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1145  AAA ATPase  25.35 
 
 
533 aa  128  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00264126  hitchhiker  0.0000264348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1108  AAA ATPase  25.16 
 
 
534 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00107728  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.81 
 
 
608 aa  55.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  24.35 
 
 
605 aa  54.7  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2521  hypothetical protein  24.51 
 
 
511 aa  54.3  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  26.09 
 
 
783 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  28.66 
 
 
605 aa  51.2  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  27.88 
 
 
611 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  25.86 
 
 
604 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  27.03 
 
 
989 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  32.37 
 
 
606 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  22.22 
 
 
628 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  26.55 
 
 
1034 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  30 
 
 
651 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1736  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  32.74 
 
 
629 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  20.87 
 
 
520 aa  45.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  27.63 
 
 
625 aa  44.3  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  26.32 
 
 
604 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.57 
 
 
524 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3852  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.58 
 
 
505 aa  43.9  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  21.01 
 
 
624 aa  43.9  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>