More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4159 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4159  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
145 aa  290  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  38.46 
 
 
954 aa  81.3  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  44.04 
 
 
223 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  43.59 
 
 
1585 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  38.46 
 
 
762 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  41.59 
 
 
257 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  37.61 
 
 
1249 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  38.24 
 
 
2171 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  39.32 
 
 
870 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  35.71 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  37.61 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.19 
 
 
2413 aa  72  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  39.82 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  32.48 
 
 
469 aa  70.9  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  39.82 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  34.19 
 
 
514 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  35.9 
 
 
541 aa  67.8  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 
1030 aa  67.4  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  35.96 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2208  Ankyrin  30.94 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00294118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  40.38 
 
 
223 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  37.01 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0637  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  37.14 
 
 
208 aa  66.6  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2080  Ankyrin  35.51 
 
 
668 aa  66.6  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000184702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  37.39 
 
 
226 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  40 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.75 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  34.27 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  39.09 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  38.18 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  34.19 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  37.17 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  37.17 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  37.17 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  37.17 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  38.18 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  38.18 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  37.17 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  37.93 
 
 
933 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_9238  predicted protein  35.45 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000233867  normal  0.286533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  32.76 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  39.29 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  37.96 
 
 
855 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  37.27 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  37.27 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  37.27 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.17 
 
 
382 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  37.27 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  35.04 
 
 
545 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
428 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  37.29 
 
 
931 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  34.19 
 
 
494 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  37.1 
 
 
821 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48392  predicted protein  32.17 
 
 
352 aa  63.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  32.5 
 
 
750 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  35.65 
 
 
248 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  33.11 
 
 
321 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  39.22 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  35.09 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  31.58 
 
 
542 aa  63.9  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0474  Ankyrin  34.75 
 
 
868 aa  63.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  36.84 
 
 
483 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  37.27 
 
 
235 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  34.21 
 
 
427 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08550  ankyrin repeat-containing protein  37.14 
 
 
248 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454701 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.96 
 
 
731 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03093  DIL and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G12450)  37.27 
 
 
1395 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148614  normal  0.215247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  35.09 
 
 
296 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  34.72 
 
 
483 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0285  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  35.65 
 
 
200 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  32.5 
 
 
287 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  36.84 
 
 
891 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  38.24 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  35.4 
 
 
236 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  29.73 
 
 
423 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  32 
 
 
1061 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  35.4 
 
 
236 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  42.05 
 
 
269 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  34.45 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  30.77 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  30.77 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  35.04 
 
 
756 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  34.96 
 
 
175 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  33.61 
 
 
447 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  33.33 
 
 
865 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  32.5 
 
 
646 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  34.19 
 
 
450 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  31.63 
 
 
578 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.91 
 
 
490 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0395  Ankyrin  33.61 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01209  proteasome regulatory particle subunit (Nas6), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10700)  39.45 
 
 
237 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  37.04 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  27.03 
 
 
1005 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2884  ankyrin  31.97 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00861842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  37.25 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8694  predicted protein  38.46 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.827941  normal  0.680946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  36.79 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  38.46 
 
 
191 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10397  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 
307 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1154  ankyrin repeat-containing protein  34.15 
 
 
440 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>