39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3312 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3312  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  284  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3461  hypothetical protein  84.43 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2757  hypothetical protein  80.33 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211967  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1288  hypothetical protein  62.69 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0512453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1548  hypothetical protein  66.67 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2977  hypothetical protein  67.21 
 
 		 128 aa  183  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2421  hypothetical protein  62.02 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2785  hypothetical protein  68.29 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2717  hypothetical protein  68.29 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.858357  normal  0.0163885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2887  hypothetical protein  67.48 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.527311  decreased coverage  0.000000752097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1356  hypothetical protein  62.69 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0148435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1370  hypothetical protein  62.69 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0350542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1395  hypothetical protein  62.69 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111146  normal  0.0209644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2989  hypothetical protein  63.64 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  hitchhiker  0.00000233878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2777  hypothetical protein  54.1 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2559  hypothetical protein  54.7 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3195  SmpA/OmlA family lipoprotein  45.08 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03048  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.02 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00049947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3296  hypothetical protein  40.83 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1124  hypothetical protein  38.26 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1517  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1253  hypothetical protein  38.1 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3175  hypothetical protein  38.18 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1333  hypothetical protein  38.64 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3539  hypothetical protein  37.78 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2650  hypothetical protein  37.9 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2831  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2724  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2657  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03042  putative lipoprotein  44.05 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2898  hypothetical protein  42.35 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1429  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1465  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1435  hypothetical protein  42.7 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.763333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2919  hypothetical protein  42.7 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1612  hypothetical protein  38.89 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3190  hypothetical protein  34.94 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3530  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.560192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2053  hypothetical protein  30.14 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000254819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>