30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2858 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  67.79 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  63.53 
 
 		 147 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  66.67 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  54.55 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  53.85 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  53.85 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  53.85 
 
 		 142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  55.24 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  52.47 
 
 		 143 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  55.94 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  90.91 
 
 		 143 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  54.62 
 
 		 120 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  60 
 
 		 136 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  48.76 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1100  hypothetical protein  30.67 
 
 		 377 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.303009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  52.38 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  53.7 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  38.21 
 
 		 110 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  49.51 
 
 		 120 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  33.05 
 
 		 117 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  39.47 
 
 		 104 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  38.53 
 
 		 104 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3107  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  24.68 
 
 		 645 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  25.32 
 
 		 640 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2901  hypothetical protein  45.24 
 
 		 157 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3095  hypothetical protein  38.38 
 
 		 98 aa  41.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  38.37 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>