50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2602 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  80.99 
 
 		 121 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  66.12 
 
 		 124 aa  173  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  55.83 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  55.83 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  55 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  54.17 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  51.67 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  48.41 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  48.8 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  47.62 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  46.83 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  42.62 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  30 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  33.9 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  37.3 
 
 		 285 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  31.67 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  23.73 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  29.36 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  27.12 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  34.58 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  31.19 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  34.58 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  25.93 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  32.5 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  27.52 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  28.44 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  28.44 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  32.71 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  28.44 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  26.21 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  25.42 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  28.44 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  26.21 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  26.21 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  31.19 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1472  hypothetical protein  29.03 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  28.1 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3783  hypothetical protein  21.43 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  27.1 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  28.18 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  27.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  30.09 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  28.3 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>