19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2055 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  74.6 
 
 		 189 aa  298  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  70.16 
 
 		 188 aa  271  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  67.03 
 
 		 194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  51.4 
 
 		 187 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  57.05 
 
 		 194 aa  190  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  51.76 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  51.76 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  51.76 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  56.58 
 
 		 191 aa  184  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  48.91 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  48.91 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  48.91 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  48.91 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  48.91 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  50.88 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  49.04 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10050  hypothetical protein  27.11 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195227  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  22.76 
 
 		 318 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>