17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1860 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  75.52 
 
 
191 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  75.52 
 
 
191 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  75.52 
 
 
191 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  75.52 
 
 
191 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  75.52 
 
 
191 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  75.26 
 
 
192 aa  274  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  74.74 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  74.21 
 
 
192 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  77.5 
 
 
191 aa  262  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  52.72 
 
 
189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  191  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  50.54 
 
 
189 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  53.04 
 
 
194 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  50.99 
 
 
186 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  45.3 
 
 
187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  43.86 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>