18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2055 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  389  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  70.16 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  72.62 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  64.02 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  53.59 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  48.37 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  48.37 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  48.37 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  48.37 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  48.37 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  55.48 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  55.92 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  53.5 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  54.84 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  54.19 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  54.19 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  50.96 
 
 		 176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  28.69 
 
 		 318 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>