18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1885 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  50.29 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  56.49 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  55.83 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  51.72 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  52.6 
 
 		 194 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  54.97 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  54.3 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  54.3 
 
 		 192 aa  177  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  50.99 
 
 		 191 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  51.66 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  51.66 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  51.66 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  51.66 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  51.66 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  51.68 
 
 		 194 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  42.29 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6259  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>