17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1922 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1922  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244558  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2053  hypothetical protein  98.96 
 
 
192 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.253437  normal  0.51249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2158  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00277574  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495.1  hypothetical protein  88.48 
 
 
191 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2248  hypothetical protein  75.66 
 
 
191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2261  hypothetical protein  75.66 
 
 
191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.950416  normal  0.0113651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2168  hypothetical protein  75.66 
 
 
191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.919734  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2123  hypothetical protein  75.66 
 
 
191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349497  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4534  hypothetical protein  75.66 
 
 
191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1860  hypothetical protein  74.21 
 
 
194 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2055  hypothetical protein  49.2 
 
 
188 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2055  hypothetical protein  50.56 
 
 
189 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2342  hypothetical protein  54.6 
 
 
194 aa  185  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.687589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2545  hypothetical protein  48.37 
 
 
189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.989498  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1885  hypothetical protein  54.3 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1819  hypothetical protein  45.79 
 
 
187 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2118  hypothetical protein  47.24 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000230137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>