28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8097 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  100 
 
 
521 aa  967    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  43.88 
 
 
3409 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  48.86 
 
 
3521 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  43.57 
 
 
1859 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  45.99 
 
 
3471 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  45.99 
 
 
3472 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  38.5 
 
 
2449 aa  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  34 
 
 
1788 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  56.72 
 
 
606 aa  70.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  37.7 
 
 
2397 aa  63.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  21.21 
 
 
842 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  50.86 
 
 
2272 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  50.86 
 
 
2179 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.78 
 
 
689 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13899  hypothetical protein  30.56 
 
 
402 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  42.24 
 
 
527 aa  50.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28970  hypothetical protein  40.45 
 
 
419 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  58 
 
 
1172 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5097  hypothetical protein  30.67 
 
 
537 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00280261  normal  0.375378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  17.37 
 
 
835 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  27.08 
 
 
1128 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  33.93 
 
 
746 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  27.12 
 
 
1142 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  30.43 
 
 
1401 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8090  hypothetical protein  32.86 
 
 
370 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9256  hypothetical protein  34.41 
 
 
380 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  40.82 
 
 
1594 aa  43.9  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1432  pseudouridine synthase, Rsu  24.87 
 
 
610 aa  43.5  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>