60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6884 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  56.93 
 
 		 209 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  30.18 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  31.68 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8040  hypothetical protein  27.13 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  27.69 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  32.03 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  30.11 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  26.83 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  30.08 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  29.38 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  28.22 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.06 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.33 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  26.9 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  24.84 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  31.29 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  29.76 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  28.21 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  24.17 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  34.48 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  29.77 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0255  protein of unknown function DUF820  22.66 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  29.51 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  29.51 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  22.58 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  23.02 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1197  hypothetical protein  28.32 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  29.69 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  33.8 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  37.31 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28.83 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  25.95 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0991  hypothetical protein  30.72 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  28.23 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  24.69 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  26.11 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  25.31 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  27.61 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  25.81 
 
 		 215 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  26.4 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  30.99 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  23.12 
 
 		 191 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  25.86 
 
 		 188 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  31.29 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  29.46 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  33.58 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>