59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8040 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8040  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  38.59 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  35.23 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  29.48 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  31.58 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  31.76 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  35.66 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1616  hypothetical protein  35.62 
 
 
108 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00151219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  33.57 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  31.72 
 
 
204 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  33.59 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  29.11 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  32.65 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  31.94 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.03 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  31.91 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1615  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  33.1 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.39 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  32.03 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
254 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  30.4 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  29.38 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1681  protein of unknown function DUF820  31.08 
 
 
203 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1663  protein of unknown function DUF820  31.08 
 
 
203 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  29.14 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 
254 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.4 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  28.39 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  28.91 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  25.66 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  26.14 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  30.08 
 
 
257 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  26.38 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  30.14 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  28.12 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  31.06 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  31.5 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  27.64 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  27.49 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1377  protein of unknown function DUF820  22.94 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  33.72 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  28.97 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  29.38 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  22.89 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  28 
 
 
239 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  28.91 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  30.97 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  26.45 
 
 
186 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  29.76 
 
 
195 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
180 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  28.76 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0255  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 
165 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  26.21 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  28.38 
 
 
188 aa  41.2  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>