170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6736 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  100 
 
 
259 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  35.89 
 
 
287 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  36.47 
 
 
258 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  34.3 
 
 
266 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  33.19 
 
 
319 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.07 
 
 
319 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  30.7 
 
 
261 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  34.07 
 
 
322 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.52 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.45 
 
 
331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  34.02 
 
 
341 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8699  hypothetical protein  29.26 
 
 
264 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.12 
 
 
358 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32 
 
 
302 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  31.56 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.58 
 
 
517 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  34.17 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  29.32 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.45 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.45 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  27.73 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  26.61 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.93 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  29.25 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.64 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  27.66 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  27.23 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.86 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.23 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  26.38 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.38 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  27.23 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  26.38 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  26.38 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  27.23 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  26.38 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.38 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  26.38 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.06 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.03 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  25.69 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  25.96 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  25.96 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  26.81 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  25.69 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.06 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  27.8 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  27.8 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.8 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  28.35 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.44 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.98 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.32 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.62 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.69 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4637  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.34 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191451  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.62 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  26.44 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.98 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  24.52 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.88 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.88 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  24.55 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.55 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.88 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.88 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  25.36 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.35 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.73 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3545  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.86 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0810177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.76 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.27 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  25.78 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  24.88 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.48 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.88 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  27.69 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.56 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.73 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  23.77 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.55 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  29.73 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  23.87 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.68 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.01 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.15 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.19 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.35 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.14 
 
 
308 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.41 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.57 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.44 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.88 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  27.06 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  25.69 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.4 
 
 
311 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.94 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.59 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>