19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4992 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4992  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1219    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2241  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  0.0319035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1303  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.27 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1302  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.879596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  39.39 
 
 		 850 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2581  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.23 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  30.6 
 
 		 2095 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  30.6 
 
 		 2095 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5052  hypothetical protein  24.54 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  26.43 
 
 		 591 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0895  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.9 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  30.6 
 
 		 1471 aa  61.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.07 
 
 		 1264 aa  58.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  27.94 
 
 		 1173 aa  54.3  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.56 
 
 		 1781 aa  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.46 
 
 		 1289 aa  48.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.09 
 
 		 1329 aa  47.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  30.25 
 
 		 1001 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.3 
 
 		 687 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>