31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3991 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 114 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4255  DNA binding domain protein, excisionase family  37.21 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  36.49 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  41.27 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  30.14 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  33.8 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0215  putative excisionase  40.45 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113601  unclonable  0.00000733316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1120  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.079823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  34.92 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  38.1 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  41.51 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1826  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  33.72 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  27.85 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  38.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  32.76 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  37.31 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  37.31 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  31.15 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.69 
 
 		 380 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  37.04 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  32.53 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>