28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3626 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  80.22 
 
 
272 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  77.78 
 
 
287 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  80.22 
 
 
272 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  87.14 
 
 
221 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  50.93 
 
 
305 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  49.39 
 
 
323 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  59.52 
 
 
260 aa  308  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  68.64 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  57.03 
 
 
272 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  58.47 
 
 
251 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  63.89 
 
 
236 aa  291  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  63.26 
 
 
229 aa  275  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  59.24 
 
 
213 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  55.66 
 
 
223 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  51.57 
 
 
231 aa  214  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  38.81 
 
 
211 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  35.05 
 
 
216 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  28.28 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  25.25 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 
442 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  24.65 
 
 
524 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  22.91 
 
 
476 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  25.41 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  22.63 
 
 
199 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  24.18 
 
 
240 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>