27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0596 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0596  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  577  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0514  hypothetical protein  70.92 
 
 
282 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0535  hypothetical protein  73.66 
 
 
282 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0540  hypothetical protein  73.66 
 
 
282 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3803  hypothetical protein  72.52 
 
 
282 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3453  hypothetical protein  70.57 
 
 
281 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0497  hypothetical protein  70.92 
 
 
281 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.664537  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3629  hypothetical protein  70.21 
 
 
281 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4075  hypothetical protein  71.84 
 
 
245 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2684  hypothetical protein  48.03 
 
 
288 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.318467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0483  hypothetical protein  47.72 
 
 
292 aa  248  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3289  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
281 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.47 
 
 
243 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2732  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3796  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814508  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  24.5 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  25.41 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>