52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4956 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4956  phage tail protein I  100 
 
 		 158 aa  323  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1138  phage-related tail protein  36.31 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0399  phage-related tail protein  36.31 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.75339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0357  phage tail protein I  35.67 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1160  phage tail protein I  35.67 
 
 		 185 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01349  phage tail protein I  32.43 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0191  phage tail protein I  38.35 
 
 		 183 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.726269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0890  phage tail protein I  36.07 
 
 		 433 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1334  phage-related tail protein  35 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4852  phage tail protein I  34.59 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37450  Phage P2 baseplate assembly gpI-like protein  36.52 
 
 		 266 aa  77.4  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4043  phage tail protein I  33.83 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.00000000000078014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3652  phage tail protein I  38.71 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0286259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1385  Phage tail protein I  30.77 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3399  tail protein I  32.48 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1940  phage tail protein I  34.19 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08040  putative phage tail protein  30.23 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000518011  hitchhiker  0.000200901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0583  phage tail protein I  29.23 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  33.33 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4134  phage tail protein I  28.33 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1922  tail formation-like protein  29.92 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.857603  normal  0.409622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3055  pyocin R2_PP, tail formation protein  29.6 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0866  phage tail protein I  29.84 
 
 		 1097 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  29.69 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1290  Phage tail protein I  32.43 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.647737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1208  phage tail protein I  30.65 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  30.5 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2899  phage tail protein I  47.37 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3485  phage tail protein I  31.45 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244882  normal  0.0401595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3190  phage tail protein I  33.33 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2655  phage tail protein I  35 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.357141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  31.58 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3034  phage tail protein I  30.16 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.8346  decreased coverage  0.00021132 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2215  phage tail protein I  28.32 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448255  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2851  phage tail protein I  28.91 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00844  putative phage tail protein  29.69 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00850  hypothetical protein  29.69 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  28.97 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3819  phage tail protein I  35.63 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2762  phage tail protein I  29.69 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0939  phage tail protein I  30.51 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1824  phage tail protein I  31.53 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2093  phage tail protein I  27.61 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2344  phage tail protein I  28.07 
 
 		 202 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2510  hypothetical protein  31.9 
 
 		 213 aa  51.2  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1620  Bacteriophage P2-related tail formation protein-like protein  34.18 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0690  Phage tail protein I  40.3 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1221  hypothetical protein  32.56 
 
 		 649 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3668  bacteriophage tail protein I  37.7 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1142  Phage tail protein I  29.13 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2381  Phage tail protein I  40 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0933  hypothetical protein  23.08 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>