More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0611 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0611  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
397 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 
407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.27 
 
 
402 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
383 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
393 aa  157  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.55 
 
 
395 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
396 aa  156  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
395 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
387 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
399 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  37.45 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  37.45 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  37.45 
 
 
382 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.67 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.67 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.54 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  41.78 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  41.82 
 
 
395 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  41.82 
 
 
395 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
392 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  41.82 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  41.82 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  41.82 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  42.59 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  42.59 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  42.59 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  42.59 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  42.59 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
395 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  36.52 
 
 
382 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.05 
 
 
400 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  41.36 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  38.99 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.39 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003574  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
397 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
384 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.69 
 
 
400 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  38.99 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 
382 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  37.2 
 
 
413 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.59 
 
 
414 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
400 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.6 
 
 
400 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
380 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  37.85 
 
 
382 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
390 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 
414 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  37.85 
 
 
382 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.33 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  37.38 
 
 
382 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  37.38 
 
 
382 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
380 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  35.89 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  37.38 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  40 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.01 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1060  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.126321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  36.67 
 
 
369 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.17 
 
 
376 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.24 
 
 
389 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1428  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.48 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1042  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
390 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  39.06 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02531  hypothetical protein  37.5 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0134  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
869 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0139  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
869 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.880882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
381 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.65 
 
 
382 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0389  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
869 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
388 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
368 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>