21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2096 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  708    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  48.55 
 
 
349 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  50.46 
 
 
335 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  45.22 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  43.58 
 
 
339 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  44.03 
 
 
332 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  42.32 
 
 
332 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  44.62 
 
 
333 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  41.64 
 
 
328 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  40 
 
 
320 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  40 
 
 
329 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  40.88 
 
 
364 aa  242  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  30.69 
 
 
352 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  25.35 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  22.44 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  31.25 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27745  predicted protein  24.41 
 
 
850 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0531336  normal  0.0916704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>