32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1850 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1850  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.245812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0820  hypothetical protein  37.69 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  27.16 
 
 		 733 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.27 
 
 		 740 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  32.33 
 
 		 721 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0570  hypothetical protein  30 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.8 
 
 		 746 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.58 
 
 		 720 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.91 
 
 		 660 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  27.97 
 
 		 733 aa  49.3  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 631 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25.95 
 
 		 725 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.15 
 
 		 725 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  27.42 
 
 		 717 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.83 
 
 		 730 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.38 
 
 		 727 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  31.11 
 
 		 734 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  22.96 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.43 
 
 		 727 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  26.49 
 
 		 717 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.26 
 
 		 719 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.95 
 
 		 756 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  27.59 
 
 		 737 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  27.69 
 
 		 600 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  27.91 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  25.9 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  31.34 
 
 		 731 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  27.74 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  36.26 
 
 		 659 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.25 
 
 		 724 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  29.85 
 
 		 720 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  29.85 
 
 		 720 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>