27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5869 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4038  hypothetical protein  36.55 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  41.57 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4420  hypothetical protein  36.36 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204685  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  36.56 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  38.61 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  40.45 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  43.56 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  34.74 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  40.54 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  36.63 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  40.2 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  31.98 
 
 		 448 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  34.95 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  33.96 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  38.27 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  40.26 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  36.04 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  46.43 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  37 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  38 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  33.33 
 
 		 264 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>