130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5150 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5150  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
147 aa  305  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2631  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  85.03 
 
 
147 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  80.95 
 
 
147 aa  264  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.171783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  77.55 
 
 
147 aa  247  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  73.47 
 
 
147 aa  237  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  72.03 
 
 
150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483226  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  72.11 
 
 
147 aa  229  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  70.55 
 
 
148 aa  225  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  70.63 
 
 
148 aa  222  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7185  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  67.83 
 
 
148 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  71.33 
 
 
149 aa  220  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0317  hypothetical protein  69.93 
 
 
148 aa  219  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  67.57 
 
 
149 aa  219  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  67.35 
 
 
147 aa  218  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3717  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.43 
 
 
148 aa  217  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1608  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  68.53 
 
 
148 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2266  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  68.53 
 
 
156 aa  215  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173847  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  67.13 
 
 
149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3535  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.83 
 
 
147 aa  209  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4801  hypothetical protein  65.03 
 
 
148 aa  204  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.54 
 
 
149 aa  197  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  59.44 
 
 
154 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3671  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  54.55 
 
 
150 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0834588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  59.15 
 
 
151 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2210  activator of Hsp90 ATPase family protein  54.61 
 
 
149 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1890  activator of Hsp90 ATPase family protein  55.1 
 
 
149 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  52.82 
 
 
146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2085  activator of Hsp90 ATPase family protein  55.17 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  35.21 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4803  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.67 
 
 
158 aa  94  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5344  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.67 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1831  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.57 
 
 
156 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948709  hitchhiker  0.00916424 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5400  activator of Hsp90 ATPase-like protein  33.33 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5461  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.67 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4808  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  0.85508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0188  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2028  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.9 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.21 
 
 
249 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1654  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5435  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.43 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.740658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.21 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0245007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0754  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0663  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1406  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.59 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  28 
 
 
286 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  28 
 
 
286 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  28 
 
 
286 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5623  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.72 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1326  activator of Hsp90 ATPase-like protein  33.61 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  27.78 
 
 
360 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1458  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.77 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520072  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.09 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.91 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.26 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  34.15 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  27.46 
 
 
360 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.86 
 
 
434 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.56 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.73 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.63 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.13 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.13 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.13 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  29.5 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1719  hypothetical protein  27.97 
 
 
161 aa  53.9  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.13 
 
 
159 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4451  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.21 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.09 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.9 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.12 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.09 
 
 
142 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2010  hypothetical protein  28.28 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.62 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0707  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117656  hitchhiker  0.00673639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.03 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  27.91 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1121  hypothetical protein  24.84 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0695467  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2032  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.58 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.61 
 
 
150 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.15 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.29 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  31.53 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2859  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.72 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  30.6 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2425  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.07 
 
 
164 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152043  normal  0.0111612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1556  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.66 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00676118  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0781  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.44 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495784  normal  0.833311 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4503  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.67 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.08 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2105  hypothetical protein  27.74 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.430302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3320  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.0000398639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  27.12 
 
 
329 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
437 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4166  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.86 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3225  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.97 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4132  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.99 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.36 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0694  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.32 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0280865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>