110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3320 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3320  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.0000398639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2886  hypothetical protein  34.48 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.27 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  32.89 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.43 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.45 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  35.77 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.41 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.65 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.58 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  28.85 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  35.9 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.9 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.72 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.9 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.29 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.94 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.76 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.72 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.25 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2413  hypothetical protein  28.48 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436069  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  32.43 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.2 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.2 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.33 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.6 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1205  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.2 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567309  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.05 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.05 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2089  activator of Hsp90 ATPase-like protein  28 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1215  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.15 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2682  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.51 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5413  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.97 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0639907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0604  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.38 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.31 
 
 
192 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.91 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0511  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.56 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742769  normal  0.149633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.57 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2882  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.16 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  35.42 
 
 
148 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.49 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4141  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.61 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1831  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.29 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948709  hitchhiker  0.00916424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.58 
 
 
322 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2028  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0484  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.89 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 
180 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.25 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  32.91 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4276  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.58 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3316  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.35 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0940618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4102  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.92 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.28 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  32.14 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  29.82 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2400  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5150  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.05 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.67 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.76 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  26.25 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  26.05 
 
 
319 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1110  hypothetical protein  26.47 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000475267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4571  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.26 
 
 
322 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.69 
 
 
165 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3225  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.52 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  28.83 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5400  activator of Hsp90 ATPase-like protein  24.38 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5461  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.38 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1608  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.15 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  30.11 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  34.29 
 
 
360 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.35 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912076  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2266  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.81 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173847  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  30.34 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4159  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.82 
 
 
295 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.83 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.05 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.14 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2779  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.9 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192987  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  27.4 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  24.18 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0317  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  30.38 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3552  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.14 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.58 
 
 
290 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.07 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.38 
 
 
249 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.67 
 
 
317 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.67 
 
 
317 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2306  hypothetical protein  26.58 
 
 
157 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3717  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1736  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.91 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4803  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.33 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>