38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1990 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  815    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  34.78 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  34.71 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  31.23 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  28.97 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  31.29 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  27.23 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.09 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  27.18 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.63 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  30.72 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  28.16 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  27.15 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  28.65 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  30.5 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  24.93 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  30.88 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  27.08 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  33.78 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  28.57 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  29.39 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  29.89 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  29.32 
 
 		 391 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.84 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  27.27 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.69 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  26.57 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  33.14 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  22.74 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0911  protein of unknown function DUF181  28.77 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0907  protein of unknown function DUF181  28.49 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  29.65 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  32.19 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  27.3 
 
 		 882 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  22.91 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  26.02 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  22.61 
 
 		 757 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  31.97 
 
 		 570 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>