17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1636 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  61.48 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  45.93 
 
 		 252 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  52.41 
 
 		 200 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  50 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0474  hypothetical protein  31.4 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.359279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0595  hypothetical protein  31.95 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4138  hypothetical protein  30.72 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000136425  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3902  hypothetical protein  31.1 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0303474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  33.08 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  41.67 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  54.55 
 
 		 968 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  33.33 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  39.74 
 
 		 207 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  38.46 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  37.18 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>