151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1121 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  75.57 
 
 		 396 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  76.47 
 
 		 396 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  814    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  72.01 
 
 		 402 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  70.13 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  63.4 
 
 		 395 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  63.14 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  63.73 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  63.59 
 
 		 411 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  59.7 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  65.74 
 
 		 411 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  61.07 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  63.51 
 
 		 409 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  62.05 
 
 		 390 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  60.61 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  59.31 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  62.63 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  59.8 
 
 		 427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  58.06 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  63.84 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  58.66 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  58.66 
 
 		 406 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  59.43 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  56.69 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  56.67 
 
 		 381 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  51.86 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  54.92 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  50.85 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  54.76 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  54.76 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  54.81 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  52.85 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  57.91 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  51.95 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  53.47 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  48.97 
 
 		 423 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  50.39 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  50.39 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  48.97 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  48.72 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  47.46 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  45.74 
 
 		 403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  45.74 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  45.21 
 
 		 375 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  44.88 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  44.42 
 
 		 375 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  44.33 
 
 		 375 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  47.61 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  45.41 
 
 		 374 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  41.82 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  41.75 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  45.81 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  43.19 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  38.34 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  42.67 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  41.21 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  42.67 
 
 		 441 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  42.67 
 
 		 441 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  37.53 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  42.67 
 
 		 464 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  42.67 
 
 		 441 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  43.61 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  42.42 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  42.42 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  44.23 
 
 		 381 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  43.33 
 
 		 392 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  43.33 
 
 		 392 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  43.33 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  43.33 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  42.39 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  43.33 
 
 		 392 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  42.78 
 
 		 392 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  42.22 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  40.26 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  37.13 
 
 		 405 aa  279  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  35.55 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  41.07 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  39.69 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  38.4 
 
 		 411 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  40.05 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  39.16 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  37.28 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  39.72 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  39.22 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  41.24 
 
 		 415 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  38.06 
 
 		 418 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  38.04 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  36.27 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  35.46 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  40.11 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  42.03 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  38.96 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  38.2 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  38.31 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  37.14 
 
 		 421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  35 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  42.38 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  36.96 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  39.52 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  39.52 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>