17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2544 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  665    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.111302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00723  hypothetical protein  47.26 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  30.17 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  32.43 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  27.68 
 
 		 230 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.53 
 
 		 271 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  30.17 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  27.91 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.03 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  31.93 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  24.22 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  25.4 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  27.68 
 
 		 799 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  27.68 
 
 		 799 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>