32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1971 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  32.92 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  34.48 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  37.56 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3043  putative cointegrate resolution protein  34.16 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  31.9 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  36.7 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  36.7 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  25.96 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  46.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  35.88 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  35.24 
 
 		 349 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  38.03 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  34.36 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  46.94 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  30.45 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  40.24 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  28.7 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  35.63 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  41.3 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  34.57 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  37.04 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1497  mucin-associated surface protein  34.31 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  29.73 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  33.04 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  43.48 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  31.97 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  44.9 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  48.94 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  34.57 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  44 
 
 		 380 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>