18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1163 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 395 aa  805    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  56.56 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  56.3 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  49.2 
 
 		 387 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  40.66 
 
 		 436 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  40.66 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  22.71 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  23.8 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  26.06 
 
 		 551 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 814 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 		 831 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>